El Laboratorio BioGeoPal tiene como objetivo el estudio integral, a través de la arqueobotánica, de la explotación de los recursos vegetales por parte de las poblaciones históricas y prehistóricas, de los marcadores antrópicos de actividades socioeconómicas y de las evidencias medioambientales de la antropización del medio. El laboratorio cuenta con una colección de heces animales, a la que se suman las colecciones arqueobotánicas. Se aplican diferentes técnicas analíticas para el estudio tanto de sedimentos como de restos botánicos, para lo cual el laboratorio dispone de una colección de referencia centrada en las distintas partes anatómicas de las plantas (como semillas, madera o raíces) y en los residuos derivados de la elaboración y trabajo de estas partes (como los fitolitos y almidones). En particular, las colecciones de referencia incluyen los siguientes elementos:

• Semillas de plantas de uso económico procedentes de centro y sur de América, sur de Asia, África y Europa.
• Herbario de plantas de interés económico procedentes principalmente de la Europa mediterránea, África, Asia y Suramérica.
• Granos e inflorescencias de cereales domésticos.
• Muestras de carbones y xiloteca de plantas leñosas mediterráneas, eurosiberianas, del sur de Asia y del extremo sur sudamericano.
• Láminas de tejidos vegetales para el estudio de fitolitos.
• Almidones.

El trabajo del BioGeoPal se desarrolla a través de proyectos de investigación propios, de la colaboración con instituciones nacionales e internacionales y de la formación de estudiantes. El laboratorio cuenta con una muy buena infraestructura de microscopía óptica (de alta y baja magnificación), con un laboratorio para el procesado químico de muestras sedimentarias y con una cámara para conservación de muestras.